中國(guó)疾控中心、南開(kāi)大學(xué)新研究發(fā)現(xiàn)：Omicron變異可能起源于老鼠
OMICRON和小鼠適應(yīng)的SARS-COV-2菌株之間共有的5個(gè)關(guān)鍵突變
2021年11月，世界衛(wèi)生組織(世衛(wèi)組織)將SARS-CoV-2變種B.1.1.529命名為“Omicron”，并將其指定為大流行開(kāi)始以來(lái)出現(xiàn)的第5個(gè)令人擔(dān)憂的變種(VOC)。
隨著Omicron病毒的迅速傳播，以及它在許多國(guó)家成為該病毒的主要毒株，科學(xué)家們一直渴望了解更多關(guān)于該變種及其起源的信息。雖然他們能夠確定Omicron是由2020年年中流行的一種菌株發(fā)展而來(lái)，但他們無(wú)法追蹤到Omicron進(jìn)化到目前形式的任何中間版本。一種觀點(diǎn)認(rèn)為，Omicron病毒感染了一種動(dòng)物，并在該動(dòng)物群體中傳播時(shí)出現(xiàn)了突變，然后再轉(zhuǎn)移到人類(lèi)身上。
近日，《生物安全與生物安?！冯s志（Journal of Biosafety and Biosecurity）在線發(fā)表了中國(guó)疾病預(yù)防控制中心徐建國(guó)院士，南開(kāi)大學(xué)公共衛(wèi)生與健康研究院孫亞民教授團(tuán)隊(duì)關(guān)于奧密克戎變異株的分析論文，題目是“Origin and evolutionary analysis of the SARS-CoV-2 Omicron variant”。
文章從進(jìn)化地位和突變模式等方面分析了新冠變異株奧密克戎的特征，對(duì)奧密克戎克戎變異株的多個(gè)小鼠適應(yīng)性相關(guān)的突變位點(diǎn)深入剖析。作者認(rèn)為奧密克戎變異株可能是在鼠宿主中進(jìn)化后回傳給人類(lèi)的。作者的研究為奧密克戎動(dòng)物性來(lái)源提供了更多的數(shù)據(jù)支持，也為新冠病毒肺炎疫情的源頭防控以及未來(lái)新發(fā)突發(fā)動(dòng)物源性傳染病的主動(dòng)防控提供重要參考。
徐教授說(shuō)，雖然在這個(gè)理論被證實(shí)之前還有很多工作要做，“我們的研究計(jì)算了五種VOC中突變的平均突變數(shù)量，并調(diào)查了病毒S蛋白的關(guān)鍵突變，即感染發(fā)生的起源。我們發(fā)現(xiàn)Omicron變異在該蛋白的5個(gè)關(guān)鍵位點(diǎn)存在突變：K417、E484、Q493、Q498和N501。
這種突變譜特征表明，病毒已經(jīng)適應(yīng)了感染老鼠的細(xì)胞。此外，按時(shí)間比例排列的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)顯示，Omicron和Gamma譜系可能在2020年中期流行，這支持了Omicron可能在非人類(lèi)動(dòng)物物種中進(jìn)化的假設(shè)。我們認(rèn)為，冠狀病毒隨著時(shí)間的推移在老鼠體內(nèi)緩慢積累突變，然后通過(guò)反向人畜共患病傳播回人類(lèi)?！?/span>
他補(bǔ)充說(shuō):“這些發(fā)現(xiàn)表明，研究人員應(yīng)該專(zhuān)注于從野生動(dòng)物，特別是嚙齒動(dòng)物中分離出的SARS-CoV-2變異。如果Omicron被確定是來(lái)自老鼠，那么它在非人類(lèi)宿主中傳播的影響將對(duì)該流行病的防控帶來(lái)新的挑戰(zhàn)?！?/p>
全文鏈接：Y. Sun, W. Lin, W. Dong, J. Xu, Origin and evolutionary analysis of the SARS-CoV-2Omicron variant, Journal of Biosafety and Biosecurity (2021), doi:
